根据中央机构编制委员会办公室中编办［１９９９］７３号文的批复及水利部《关于成立水利部水文局和水资源水文司更名的通知》（水人教［１９９９］３５０号文）精神，成立水利部水文局，与水利部水利信息中心一个机构两块牌子；将水利部水资源水文司承担的有关指导全国水文工作的职能及其人员归入水利部水文局。１９９９年８月４日，水利部水文局正式宣布成立。随后，水利部水文局即加紧制定职能配置、内设机构和人员编制规定的“三定”方案，并上报水利部审批。１９９９年１１月１０日，水利部以人教劳［１９９９］８３号文批复水利部水文局（水利信息中心）“三定”方案。该文件指出：根据中编办［１９９９］ ７３号、水人教［１９９９］３５０号文件精神，你局（中心）为我部承担行政管理职责的事业单位。 水利部水文局的成立，是党和国家重视和加强水文工作的充分体现，也是全国水文系统广大职工非常关注的大事，必将对我国水文事业的发展产生巨大的推动作用。现将水利部水文局（水利信息中心）的主要职责、内设机构和人员编制刊登如下，以飨读者。